La Plateforme de Génétique Moléculaire (PGM), située au Centre de Biologie, 3e étage, CHU Montpied, est une plateforme de séquençage NGS (Next Generation Sequencing) partagée par plusieurs services du CHU (Biologie moléculaire, Cytogénétique, Hématologie, Bactériologie, Histocompatibilité et Anatomie et cytologie pathologiques).
Cette plateforme propose également des prestations de séquençage externes.
Elle dispose pour cela de trois séquenceurs NGS Illumina : 2 MiSeq et 1 NextSeq500. Elle dispose également de plusieurs automates pour la préparation des librairies (Qubit, TapeStation, Robots BeckMan pré et post PCR).
Equipement
Pour les activités de diagnostic et de recherche, la plateforme de séquençage du CHU de Clermont-Ferrand dispose :
- de 2 séquenceurs Illumina MiSeq
- d’1 séquenceur Illumina NextSeq500
Prestations
Différents types de prestations sont proposées sur la plateforme :
- Séquençage ADN / ARN en panel de gènes
- Séquençage exome complet
- Séquençage de souches bactériologiques
- Aide et conseils pour la conception des protocoles d’analyse
- Aide et conseils pour l’analyse bioinformatique et l’exploitation des résultats
Tarification
En cours
Règlement intérieur
Tout utilisateur doit avoir lu et acquitté la charte d’utilisation de la plateforme.
